زینب جلالیان در سال 1386 به اتهام محاربه با خدا و اقدام علیه امنیتی ملی دستگیر شد. دادگاه انقلاب در ابتدا حکم اعدام برای وی صادر که بعدها حکم وی از سوی دیوان عالی کشور نقض و به حبس ابد تقلیل یافت.
سازمان عفو بین الملل در مورد از دست دادن بینایی بانو جلالیان هشداری را منتشر نمود.
سازمان حقوق بشر نیز گزارشی در خصوص نقض حقوق بشر در مورد زینب جلالیان را انتشار داد و بدین نکات در آن اشاره کرد:
دستگیری نامبرده بدون داشتن مدرکی محکمه پسند و محروم بودن از داشتن وکیل مدافع و مشاور حقوقی، نقض پرتوکول قوانین منع شکنجه و آزار و اذیت( که حاکمیت کنونی ایران آنرا امضاء کرده است) همراه با ممنوعیت داشتن ملاقات حضوری تا به تلفنی با خانواده اش و محرومیت وی از خدمات درمانی که از ابتدایی ترین حقوق یکی زندانی است را ذکر نمود.
نامبرده هم اکنون نیز در وضعیت وخیمی در زندان بسر میبرد.